11-летняя Мэри, летом скучающая у двоюродной бабушки Шарлотты в деревне, обнаруживает в лесу редкий и цветущий лишь раз в семь лет цветок ночной полёт. Но цветок этот некогда был похищен из Страны ведьм, и с его помощью Мэри обретает способность летать на метле, которая уносит её в Эндор – школу ведьм – где директриса мадам Мамблчук принимает её за новую (и многообещающую) ученицу.
Однажды Тиб и Гиб, коты Питера, приводят Мэри к таинственным светящимся цветкам. Зеведей, садовник, опознаёт сорт цветов как «Ночной полёт»; легенда гласит, что цветок обладает ведьмовской магической силой. На следующий день Гиб исчезает, и Мэри идёт за Тибом, чтобы искать Гиба. Тиб приводит её к метле, торчащей из корней дерева. Мэри вытаскивает метлу, но случайно раздавливает на ней бутон цветка. Бутон высвобождает магическую силу в виде синего студенистого вещества, заставляя метлу ожить и Мэри теперь может летать на ней, как ведьма. «Маленькая метла» уносит Мэри и Тиба к комплексу зданий, скрытому в облаках, и известному как Эндор – школа для ведьм. Директриса мадам Мамблчук думает, что Мэри это новая ученица, а Тиб – её фамильяр, и ведёт её на экскурсию по школе.